Τη Διοίκηση και Διαχείριση του Τμήματος άσκησαν κατά καιρούς, από την ίδρυσή του μέχρι το 1992 διορισμένοι Καθηγητές άλλων Τμημάτων ή Σχολών του Πανεπιστημίου, οι οποίοι ήταν και μέλη Πρυτανικών αρχών. Το 1992-93 άρχισε η αυτοδύναμη διοίκηση του Τμήματος με εκλεγμένα όργανα.
Διατελέσαντες προέδροι του Τμήματος
Δέρρη Βασιλική
Καθηγήτρια Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Δούδα Ελένη
Καθηγήτρια Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγήτρια Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Μιχαλοπούλου Μαρία
Καθηγήτρια Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγήτρια Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Αγγελούσης Νικόλαος
Αν. Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Αν. Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Μαυρομάτης Γεώργιος
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Ταξιλδάρης Κυριάκος
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Γκοδόλιας Γεώργιος
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Κιουμουρτζόγλου Ευθύμιος
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Καθηγητής Τ.Ε.Φ.Α.Α.
Λιώλιος Αστέριος
Καθηγητής Πολιτικών Μηχανικών
Καθηγητής Πολιτικών Μηχανικών
Πανούσης Γιάννης
Καθηγητής Νομικής Σχολής
Καθηγητής Νομικής Σχολής
Παπαδόπουλος Δημήτριος
Καθηγητής Ηλεκτολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών
Καθηγητής Ηλεκτολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών
Σαββίδης Σταύρος
Καθηγητής Πολιτικών Μηχανικών
Καθηγητής Πολιτικών Μηχανικών